民國80年代，政府為了持續推動經濟發展，積極進行各種重大公共建設，以增進民間投資，但政府實質收入，因景氣變化，以及多項賦稅減免措施的影響，無法相對成長，政府債務負擔日益沈重。

89年開始，中央政府概括承受原臺灣省政府債務，同時為因應921震災、提振經濟景氣，持續透過赤字預算的方式，擴大公共建設支出，年度總預算當中赤字比重逐年提高，政府債務餘額也不斷增加。90年時，中央政府債務累計未清償餘額達到了2兆7千多億元，對於國家財政長期穩健發展來說，產生連串警訊。

90年8月，總統府召集「經濟發展諮詢委員會」，在會議結論當中，希望透過政府組織再造，提高行政效率，降低政府支出規模；並推動租稅制度改革，進行稅制結構調整，追求政府收支平衡、租稅公平、經濟發展、稅政簡化；同時決議由行政院成立財政改革委員會，積極從事稅制改革，以5年到10年的期程，達成財政收支平衡目標。

為了討論達成經濟發展諮詢委員會的相關意見，行政院於90年9月14日成立了「行政院財政改革委員會」，由行政院主計處、經建會、研考會、人事行政局、經濟部、財政部等6位機關代表與4位工商團體代表，以及9位財經學者，共19位成員組成。

行政院財政改革委員會由財政部部長擔任召集人，針對稅課收入、非稅課收入及支出等相關層面，研討完成「財政改革方案」，作為各單位執行的藍本。行政院財政改革委員會並由財政部國庫署同仁，負責擔任工作人員。

92年4月4日，行政院財政改革委員會完成相關工作，針對38項課題，先後召開20次會議，規劃的財政改革方案中，將改革措施，依實施期間分為短、中、長期。

改革方案中，檢討目前的財政問題，主要是因為政府支出結構性擴大，社會福利支出易增難減，政府人事費用與退撫支出居高不下，造成了財政上的沈重負擔，並且相對經濟建設支出產生排擠效應，影響政府推動政策所需要的其他支出。

在賦稅收入部分，由於多年來的各項賦稅減免措施，使得政府稅基屢受侵蝕，政府的穩定收入逐步下降，從87年至91年，租稅占政府歲出的比例，由82％急速降至55％，不但政府財政收入不穩定，更使得社會質疑稅收公平性；加上原本可有盈餘繳庫的公營事業反而因市場激烈競爭而虧損，使得財政情況日益惡化。

針對上述情形，行政院財政改革委員會提出具體的政策建議，希望健全財政制度、促進經濟發展、增進社會福祉，在5到10年當中，達成財政平衡目標：

在稅課收入部分，行政院財政改革委員會建議擴大稅基，取消職業別、產業別以及不合時宜的租稅減免，如軍教人員免稅，調整租稅結構；適度調高營業稅稅率，廢除印花稅；取消不合時宜的貨物稅課稅項目；適度調降遺產稅及贈與稅稅率；檢討土地稅課稅方式；並且針對租稅迴避問題，進行檢討，希望使國民租稅負擔率達成合理水準。

在非稅課收入部分，行政院財政改革委員會提出建立公用土地為國家整體性資產的觀念，並且設定國有財產未來5到10年當中，挹注財政收入的具體目標額度；落實使用者、受益者、污染者付費原則；加強非營業基金的運作與管理；加強公營事業民營化，加速處理經營虧損的國營企業；並且合理規範公債發行政策。

在政府支出部分，以控制名目政府支出零成長為基準，落實新增支出必須有新增財源作為同步考量，並且整合現行社會福利支出的給予方式及標準。

92年7月，財政部將上述的改革意見，及各項研究主要結論編印為《行政院財政改革委員會會議實錄》上、下兩冊，作為未來財政改革的推動要綱。