關稅配額制度（Tariff Rate Quotas, TRQ）是我國加入世界貿易組織（World Trade Organization, WTO）之後，實施限制進口貨物數量的措施，關稅配額為了兼顧保護國內產業，以及市場逐步開放的雙重需求而產生，並且廣泛地為世界貿易組織會員國所採用。

進口國針對某種進口貨物，制定一定的配額數量限制，在配額範圍內的貨品，適用較低稅率，或者予以免稅優惠；超過配額數量的進口貨物，適用一般或者較高的稅率，但是關稅配額並未限制某種進口貨物的總進口數量，因此對於開放市場，仍有正面積極的作用。

世界貿易組織的前身，是於民國36年（西元1947年）成立的關稅暨貿易總協定（General Agreement on Tariffs and Trade, GATT）。第二次世界大戰之前，許多國家推動保護關稅與貿易壁壘政策，限制國外產品進口，造成國際經濟整體蕭條，極權主義得以在金融崩潰的情形下迅速滋長。

為了避免戰後重蹈覆轍，共有23個國家率先簽署關稅暨貿易總協定，中華民國也身為創約締約國之一，但由於戡亂戰局逆轉，政府喪失對於大陸地區關稅領域的有效管轄，因此於39年時宣布退出。

世界貿易組織於84年（1995年）正式成立，希望藉由這一組織的創設，創造出自由、公平的貿易環境，達成無歧視貿易，使所有會員國都享有最惠國待遇（Most-Favored- Nation Treatment）與國民待遇（National Treatment），各國利益均霑；鼓勵會員國經由談判，逐步開放國內市場，持續調降關稅，促進國際貿易，並且消除非關稅障礙，開放服務貿易市場，加強智慧財產權保護。

世界貿易組織並要求，會員國經由約束關稅與農業補貼，承諾開放服務業市場等措施，加強未來市場開放的可預期性，會員國原則上不得對進出口貨物設置配額，關稅雖然可以用於保護國內產業，但必須受到限制，各國承諾調降稅率之後，未來便不能超過這一約束稅率，否則便需要對其他會員國做出補償。

過往對於進口農產品的非關稅限制，例如數量限制、變動差異金、最低進口價格、進口許可的行政裁量等項目，都應該轉化為關稅，並且分6年予以調降。

全球各個主要國家或地區先後加入世界貿易組織，主要的國際貿易都在架構下接受規範。參加世界貿易組織，不僅使本國產品享有最惠國待遇與國民待遇，增強出口競爭力，並使本國得以參與制定國際經貿規範，提升國家地位，藉由爭端解決機制，處理國際貿易糾紛，又能透過調降關稅，提升消費者福祉。

早在79年1月1日，我國便按照關稅暨貿易總協定第33條規定，以在對外貿易關係上具有自主權利地位的「臺灣、澎湖、金門及馬祖個別關稅領域」，向關稅暨貿易總協定提出入會申請，經過多年的談判努力，終於在90年時，完成各項雙邊與多邊入會經貿諮商，並於次年成為由關稅暨貿易總協定演變而來的世界貿易組織第144個會員國。

在加入世界貿易組織前，我國為保護產業，對於部分的農工產品，採取管制進口，或者限制地區進口的措施，與其他國家諮商過程中，這些非關稅障礙一一取消，為了降低對產業的衝擊，政府將部分農產品與工業產品小汽車，透過適用關稅配額的方式開放進口。

以94年為例，實施關稅配額的農產品共有食米、鹿茸、東方梨、香蕉、紅豆、液態乳、花生、大蒜、乾香菇、乾金針、椰子、檳榔、鳳梨、芒果、柚子、柿子、桂圓肉、鯖魚、鰛魚、鰺魚等20項。如鹿茸的配額數量為5公噸，配額內稅率為22.5％，超過配額的進口鹿茸，則課徵620％的關稅，差異相當之大。

我國農產品關稅配額的管理核配方式，分為先到先配，依進口商申請先後順序抽籤，或者標售進口權利，以出價高得標，進口商獲得關稅配額證明書後，必須在期限內使用，否則配額便失效無用。

全年度的配額依照市場機制，未必會使用完畢，以94年為例，鹿茸、東方梨、紅豆、花生及椰子等6項產品，因國外產品價格低廉，進口暢旺，配額使用率高達99％以上；蒜頭則因為國內滯銷，進口意願低落，直到國內蒜頭供應不足時，配額使用率才大為提升。另小汽車之關稅配額核配方式，係以其進口日之先後順序核配。

依照我國加入世界貿易組織時，所做出的入會關稅減讓承諾，實施關稅配額的農產品當中，豬腹脅肉、雞肉、豬雜碎以及家禽雜碎等4項，已由94年起，取消關稅配額；砂糖因為國內自發性的需要，由政府宣布，自同年2月起取消關稅配額；柿子及鯖魚、鰮魚及鰺魚等3種魚類產品，則在97年起取消關稅配額。

自97年起迄今，實施關稅配額的農產品共有食米、鹿茸、東方梨、香蕉、紅豆、液態乳、花生、大蒜、乾香菇、乾金針、椰子、檳榔、鳳梨、芒果、柚子、桂圓肉等16項。

工業產品方面的小汽車，在100年時取消關稅配額，透過逐步降低關稅，以及取消關稅配額，將可以使得國內消費者，選擇更多物美價廉的產品。